一、種子類藥材的加工 尸般果實采收后直接曬干、脫粒、收集種子。有些藥材要去種皮或果皮，如薏苡、決明子等；有些要擊碎果核，取出種仁供藥用，如杏仁、酸棗仁等；有些則要蒸，以破壞藥材易變質變色的酵素，如五味子、女貞子等。
二、花類藥材的加工 為了保持花類藥材顏色鮮艷、花朵完整，采后應放置在通風處攤開陰干或在低溫下迅速烘干，以避免有效成分的散失，保持濃郁的香氣，如紅花、金銀花、玫瑰花、月季花等。極少數種類則需先蒸再進行干燥，如杭白菊等。
三、果實類藥材的加工 一般果實類藥材采收后直接曬干或烘干即可。但果實大又不易干透的藥材，如佛手、酸橙、宣木瓜等應先切開后干燥；以果肉或果皮人藥的藥材，如陳皮、山茱萸等，應先除瓤、核或剝皮后干燥。此外，有的藥材如烏梅等還需經烘烤、煙熏等方法加工。
四、皮類藥材的加工 一般采后趁鮮切成片或塊，再曬干即成。但有些種類在采收后應趁鮮刮去外層的栓皮，再進行干燥，如丹皮、椿根皮、黃板皮等；有些樹皮類藥材采后應先用沸水略燙后，加碼疊放，使其“發汗”，等內皮層變成紫褐色時，再蒸軟刮去栓皮，然后切成絲、片或卷成筒，再進行干燥，如肉桂、杜仲等。
五、全草和葉類藥材的加工 采收后宜放在通風處陰干或晾干，尤其是含芳香揮發油類成分的藥材，如薄荷、荊芥、藿香等忌曬，以避免有效成分損失；有些全草類藥材在未干透前就應扎成小捆，再晾至全干，如紫蘇、薄荷、斷血流等。一些含水量較高的肉質葉類，如馬齒莧、垂盆草等應先用沸水略燙后再進行干燥。
六、根及地下莖類藥材的加工 這些藥材采收后，一般須先洗凈泥土，除去須根、蘆頭和殘留枝葉等。再進行大小分級，趁鮮切成塊或段，然后曬干或烘干即成。如白芷、丹參、牛膝等；一些肉質性、含水量較高的塊根、鱗莖類藥材，如天冬、百部等，應先用沸水稍燙一下，然后再切成片曬于或烘烤；對于質堅難以干燥的粗大根莖類藥材，如玄參、葛根等應趁鮮切片，再進行干燥；對于干燥后難以去皮的藥材，如丹皮、桔梗等應趁鮮刮去栓皮；對那些含淀粉、漿汁足的藥材，如天麻、地黃等應趁鮮蒸制，然后切片曬干。有些種類如北沙參、明黨參等應先放人沸水中略燙一下，再刮皮、洗凈、干燥；此外，如丹參、玄參等藥材，先要經沸水煮，再經反復“發汗”才能完全干燥。還有些藥材如山藥、貝母等須用硫磺熏蒸才能較快于燥．保持色澤潔白，粉性足，且能消毒、殺蟲、防毒。